Монастырь Санаин представляет собой комплекс состоящий из церкви Сурб Аствацацин (Св. Богородицы), церкви Аменапркич, часовни Сурб Григор (X в.), здания академии (XI в.), книгохранилища (XI в.), здания галереи (X в.), притвора (XII в.) и колокольни (XIII в.).

Все эти сооружения сгруппированы вокруг старейшей постройки - церкви Святой Богородицы. Здание сложено из базальта и представляет собой крестово - купольный храм с четырьмя приделами по всем сторонам. Академия была исторически известна как Академия Григора Магистроса Пахлавуни. Большое внимание в ней уделялось изучению гуманитарных наук.

Здесь преподавали выдающиеся армянские ученые. В исторических хрониках сохранились упоминания о том, что отправляемые из Армении заграницу посольства сопровождались советниками из числа ученых Санаина. Уже в XII веке в Санаине существовала медицинская школа. В ней изучались анатомия и физиология человека. Санаин дал несколько известных представителей национальной культуры, таких как народный певец и музыкант Саят - Нова.

Монастырь Ахпат, находящийся к северо - востоку от Санаина, построен по его подобию. Здесь также изучали гуманитарные науки, богословие, занимались живописью. Интересной особенностью Ахпата является трапезная (XIII в.). В ней поражает огромное пространство вытянутого зала.

Монастыри Санаин и Ахпат занесены в список Всемирного Наследия ЮНЕСКО (1996).